試料中のDNA定量、特定のウイルスや微生物の検出・定量、mRNA発現解析などを行う装置です。目的とする塩基配列をポリメラーゼ連鎖反応（PCR）により増幅させ、蛍光試薬を用いて増幅の程度をリアルタイムに測定することで解析を行います。母乳中サイトメガロウイルスDNAの定量などに用いています。